MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	CAC	2	6	56	61	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009457	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009457	AGATC	2	10	136	145	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009457	GA	3	6	164	169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009457	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009457	GC	3	6	315	320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009457	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009457	GAG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009457	ATC	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009457	TGA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009457	CTA	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009457	T	6	6	576	581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009457	GCG	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009457	AAT	2	6	774	779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009457	CCT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009457	CAT	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009457	ATG	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009457	T	6	6	882	887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009457	CTT	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
20	NC_009457	CAT	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674855
21	NC_009457	CTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
22	NC_009457	TGT	2	6	1086	1091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674855
23	NC_009457	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
24	NC_009457	GTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
25	NC_009457	GCA	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
26	NC_009457	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
27	NC_009457	TGG	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675529
28	NC_009457	GCT	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
29	NC_009457	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
30	NC_009457	GGCAA	2	10	1637	1646	40 %	0 %	40 %	20 %	147675529
31	NC_009457	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675529
32	NC_009457	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	147675529
33	NC_009457	AGC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
34	NC_009457	GC	3	6	1826	1831	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
35	NC_009457	T	6	6	1871	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	147675529
36	NC_009457	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675529
37	NC_009457	CGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675529
38	NC_009457	TCAC	2	8	1971	1978	25 %	25 %	0 %	50 %	147675529
39	NC_009457	GCT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
40	NC_009457	GC	3	6	2006	2011	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
41	NC_009457	GTA	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675529
42	NC_009457	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
43	NC_009457	GCG	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675529
44	NC_009457	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
45	NC_009457	TTG	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
46	NC_009457	ATT	3	9	2270	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009457	CAC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674068
48	NC_009457	TGG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674068
49	NC_009457	GGC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674068
50	NC_009457	TAA	2	6	2428	2433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674068
51	NC_009457	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
52	NC_009457	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
53	NC_009457	TCG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
54	NC_009457	GATT	2	8	2634	2641	25 %	50 %	25 %	0 %	147674960
55	NC_009457	CCAG	2	8	2643	2650	25 %	0 %	25 %	50 %	147674960
56	NC_009457	CA	3	6	2876	2881	50 %	0 %	0 %	50 %	147674960
57	NC_009457	TTC	2	6	2917	2922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674960
58	NC_009457	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674960
59	NC_009457	CAC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674960
60	NC_009457	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
61	NC_009457	ACTG	2	8	3034	3041	25 %	25 %	25 %	25 %	147674960
62	NC_009457	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
63	NC_009457	TGA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
64	NC_009457	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674960
65	NC_009457	TTCA	2	8	3261	3268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009457	GTCT	2	8	3282	3289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009457	GCC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009457	AGT	2	6	3334	3339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009457	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009457	TAA	3	9	3437	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674885
71	NC_009457	CAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
72	NC_009457	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
73	NC_009457	GAA	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674885
74	NC_009457	ACCA	2	8	3588	3595	50 %	0 %	0 %	50 %	147674885
75	NC_009457	TGC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674885
76	NC_009457	CT	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	147674885
77	NC_009457	GCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
78	NC_009457	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
79	NC_009457	CAA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674885
80	NC_009457	CAAA	2	8	4142	4149	75 %	0 %	0 %	25 %	147674885
81	NC_009457	ATG	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
82	NC_009457	ATT	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
83	NC_009457	CTCG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	25 %	50 %	147674885
84	NC_009457	CG	3	6	4329	4334	0 %	0 %	50 %	50 %	147674885
85	NC_009457	GCA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009457	GCC	2	6	4527	4532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009457	CTGCAA	2	12	4536	4547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009457	TTC	3	9	4600	4608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
89	NC_009457	ATC	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675539
90	NC_009457	GTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
91	NC_009457	TCAA	2	8	4784	4791	50 %	25 %	0 %	25 %	147675539
92	NC_009457	A	6	6	4807	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	147675539
93	NC_009457	CAAC	2	8	4836	4843	50 %	0 %	0 %	50 %	147675539
94	NC_009457	CG	3	6	4896	4901	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
95	NC_009457	TGG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
96	NC_009457	GC	3	6	4959	4964	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
97	NC_009457	AG	3	6	5185	5190	50 %	0 %	50 %	0 %	147675539
98	NC_009457	GCG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
99	NC_009457	TGCT	2	8	5233	5240	0 %	50 %	25 %	25 %	147675539
100	NC_009457	TGG	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
101	NC_009457	GCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
102	NC_009457	CTT	2	6	5328	5333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
103	NC_009457	GCA	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
104	NC_009457	CG	3	6	5525	5530	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
105	NC_009457	ACC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675539
106	NC_009457	GCA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
107	NC_009457	CAG	2	6	5641	5646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
108	NC_009457	GCAC	2	8	5721	5728	25 %	0 %	25 %	50 %	147675539
109	NC_009457	GCT	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
110	NC_009457	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
111	NC_009457	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
112	NC_009457	TTC	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673291
113	NC_009457	TGC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
114	NC_009457	GTG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
115	NC_009457	ATC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
116	NC_009457	CA	3	6	6006	6011	50 %	0 %	0 %	50 %	147673291
117	NC_009457	CG	3	6	6019	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
118	NC_009457	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673291
119	NC_009457	AGC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
120	NC_009457	GC	3	6	6108	6113	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
121	NC_009457	GC	3	6	6128	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
122	NC_009457	ATC	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
123	NC_009457	TGA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673291
124	NC_009457	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
125	NC_009457	CGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
126	NC_009457	CGT	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009457	AGT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
128	NC_009457	CTT	2	6	6572	6577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673975
129	NC_009457	CG	3	6	6669	6674	0 %	0 %	50 %	50 %	147673975
130	NC_009457	GTTGA	2	10	6757	6766	20 %	40 %	40 %	0 %	147673975
131	NC_009457	T	6	6	6800	6805	0 %	100 %	0 %	0 %	147673975
132	NC_009457	GCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673975
133	NC_009457	AGT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
134	NC_009457	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673975
135	NC_009457	A	6	6	6887	6892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009457	ATT	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674564
137	NC_009457	TGGCT	2	10	6949	6958	0 %	40 %	40 %	20 %	147674564
138	NC_009457	TTGT	2	8	6972	6979	0 %	75 %	25 %	0 %	147674564
139	NC_009457	CAC	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674564
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141	NC_009457	TTC	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674564
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243	NC_009457	TCA	2	6	12516	12521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_009457	GAAT	2	8	12603	12610	50 %	25 %	25 %	0 %	147673691
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249	NC_009457	G	7	7	12818	12824	0 %	0 %	100 %	0 %	147673691
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251	NC_009457	GTGA	2	8	12902	12909	25 %	25 %	50 %	0 %	147673691
252	NC_009457	TGA	2	6	12966	12971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673691
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264	NC_009457	TG	3	6	13652	13657	0 %	50 %	50 %	0 %	147673691
265	NC_009457	GC	3	6	13727	13732	0 %	0 %	50 %	50 %	147673691
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